La familia de genes del receptor olfativo humano (hOR) está constituida por
cerca de 800 genes y pseudogenes. Un estudio previo demostró que existe
una correlación entre los agrupamientos cromosómicos de los genes y los
agrupamientos topológicos de los árboles filogenéticos, sugiriendo una
expansión de la familia a partir de cierto grupo ancestral de genes (Niimura
& Nei, 2003). A fin de investigar si dicha relación compromete a las
regiones promotoras de los genes, fueron analizados 385 Genes hOR
obtenidos de la base de datos HORDE, Mediante diferentes algoritmos
bioinformáticos de alineamiento, filogenia y minería de datos. El
descubrimiento y definición de dos modelos estructurales de promotor a
partir de motivos altamente conservados dentro de las regiones
promotoras, ha permitido afirmar que los mecanismos de regulación
transcripciónales son comunes a grupos de genes filogenéticamente
distantes que no se encuentran asociados a los agrupamientos
cromosómicos y filogenéticos establecidos anteriormente y en el presente
trabajo.
The human olfactory receptor gen family (hOR) is consist of about 800
genes and pseudogenes. One previous study showed that there exist a
relationship between the chromosomic clustering and phylogenetic
topological clustering suggesting how the hOR gene family has expanded
for the entire genome from an ancestral gene group (Niimura & Nei, 2003).
In this work we study 385 genes hOR of the HORDE database (by mean of
different bioinformatics tools, such as, aligment, phylogenetic trees and
datamining), in order to find out whether the promoter sequences are
involved on this relationship. We found and characterized two structural
models of promoter, starting from high conserved motifs in the promoter
regions, and we stablish that the transcriptional regulation mechanims are
the same to group of genes distantly in the phylogenetic tree, different to the
chromosomic clustering and phylogenetic topological clustering stablish in
this staudy and others works.
