Estimación de la relación, entre la secuencia de los genes funcionales hORs (receptores del olfato humano) con su localización cromosómica, mediante herramientas bioinformáticas

Abstract

La familia de genes del receptor olfativo humano (hOR) está constituida por cerca de 800 genes y pseudogenes. Un estudio previo demostró que existe una correlación entre los agrupamientos cromosómicos de los genes y los agrupamientos topológicos de los árboles filogenéticos, sugiriendo una expansión de la familia a partir de cierto grupo ancestral de genes (Niimura & Nei, 2003). A fin de investigar si dicha relación compromete a las regiones promotoras de los genes, fueron analizados 385 Genes hOR obtenidos de la base de datos HORDE, Mediante diferentes algoritmos bioinformáticos de alineamiento, filogenia y minería de datos. El descubrimiento y definición de dos modelos estructurales de promotor a partir de motivos altamente conservados dentro de las regiones promotoras, ha permitido afirmar que los mecanismos de regulación transcripciónales son comunes a grupos de genes filogenéticamente distantes que no se encuentran asociados a los agrupamientos cromosómicos y filogenéticos establecidos anteriormente y en el presente trabajo.

The human olfactory receptor gen family (hOR) is consist of about 800 genes and pseudogenes. One previous study showed that there exist a relationship between the chromosomic clustering and phylogenetic topological clustering suggesting how the hOR gene family has expanded for the entire genome from an ancestral gene group (Niimura & Nei, 2003). In this work we study 385 genes hOR of the HORDE database (by mean of different bioinformatics tools, such as, aligment, phylogenetic trees and datamining), in order to find out whether the promoter sequences are involved on this relationship. We found and characterized two structural models of promoter, starting from high conserved motifs in the promoter regions, and we stablish that the transcriptional regulation mechanims are the same to group of genes distantly in the phylogenetic tree, different to the chromosomic clustering and phylogenetic topological clustering stablish in this staudy and others works.