Resumen:
La criptococosis, es una micosis sistémica, oportunista que afecta principalmente el sistema nervioso central de pacientes inmunosuprimidos, ocasionada por los miembros del complejo Cryptococcus neoformans/Cryptococcus gattii. Esta enfermedad ha retomado gran importancia debido a la aparición de la epidemia del sida, que recientemente ha marcado el estudio de la ecología y epidemiología de éste hongo. Este trabajo tiene como objetivos principales, caracterizar molecularmente los aislados de C. neoformans y determinar la frecuencia de distribución del hongo en el perímetro urbano de la ciudad de Popayán, en las excretas de paloma común (Columba livia) y Garcita de ganado (Bubulcus ibis). Se recolectaron 303 muestras de excrementos de C. livia y B. ibis, entre septiembre de 2012 a junio de 2013. Estas muestras fueron procesadas por técnicas convencionales; se aisló entre 5 a 18 colonias por muestra; la identificación de las colonias se realizó mediante pruebas bioquímicas y el patrón molecular se identificó mediante PCR huella digital con el iniciador (GTG)5 y Polimorfismos de Restricción de Fragmentos Amplificados (RFLP) del gen URA5. Se identificaron 118 (38.94%) muestras que fueron positivas para Cryptococcus spp. en excretas de C. livia; se recuperaron 361 cepas de excrementos pertenecientes a C. neoformans var. grubii de las cuales 99,2% fueron patrón molecular VNI y 0,8% VNII, con una alta recuperación (24,4%) a una temperatura de 22,5°C y una humedad de 60,8%. Además se encontraron otras levaduras tipo Candida spp. y Rhodotorula spp. El análisis estadístico se realizó con el software estadístico SPSS v. 15, donde se aplicaron análisis de Chi2, tablas de conglomeración, T3 de Dunnett y HSD de Tukey para determinar diferencias significativas entre los datos recolectados. Las excretas de C. livia son uno de los nichos fundamentales de C. neoformans var. grubii, hábitat ideal para su crecimiento, reproducción y dispersión, convirtiéndose en una de las principales fuentes de infección para pacientes susceptibles a ésta micosis.
