Resumen:
Se caraterizaron los mamíferos acuáticos y relacionados con el agua en los diferentes ecositemas acuáticos continentales y estuarinos de las zonas distribución de la Meseta de Popayán (MP), Vertiente Oriental (VO) y Occidental de la Cordillera Occidental (VOO), Selva Húmeda del Pacífico (SHP) y Zona Costera (ZC), en nueve municipios de los departamentos de Cauca y Nariño, entre los años 2010 y 2011. Para efectos de conocer la riqueza de especies y establecer su distribución potencial, se emplearon métodos de colecta directos, como trampas tipo Sherman, Tomahawk y Redes de niebla en las diferentes estaciones; además, métodos de observación directa (recorridos y puntos de observación) e indirectos (búsqueda de rastros y entrevistas con los habitantes locales). En total Se registraron 13 especies correspondientes a 10 géneros e igual número de familias en 5 órdenes de mamíferos acuáticos y relacionados con el agua. En cuanto a la distribución de especies, géneros y familias se logró establecer que los mamíferos asociados a los diferentes ecosistemas acuáticos continentales como: Chiroptera presentaron el 38,4% (S: 5 spp), Rodentia 30,7% (S: 4 spp), Perissodactyla 15,4% (S: 2 spp) y Didelphimorphia 7,69% (S:1 spp). En cuanto a los mamíferos semiacuáticos, se reportó una especie para el orden Carnívora con el 7,69% (S: 1 spp). La la Selva Húmeda reportó la mayoría de las especies de mamíferos con hábitos acuáticos y relacionados con el agua y la Meseta de Popayán presentó la menor riqueza de especies. El 45,5% de los reportes se realizó a través de métodos directos de observación seguido de la observación indirecta realizada a través de la ubicación de huellas, rastros de alimentación, heces o letrinas para el caso de la nutria neotropical L. longicaudis. Los métodos de captura directa como las trampas Sherman y Tomahawk aportaron el 9.1% del total de los registros demostrando su efectividad captura para los roedores como Hoplomys gymnurus en la Vertiente Occidental de la Cordillera Occidental y Selva Húmeda del Pacífico. La similaridad entre las estaciones realizadas entre la Selva Húmeda Tropical y L Vertiente Occidental fue del 78% presentando especies comunes como L. longicaudis que es un carnívoro con amplia distribución, Roedores como Cuniculus paca, Hoplomys gymnurus y Hydrochoerus isthmius entre otras especies. A su vez en la fase de campo se identificaron como las principales actividades impactantes sobre las poblaciones de este tipo de mamíferos que posiblemente determinan la riqueza, abudancia y distribución de las diferentes poblaciones en las áreas de estudio.